黔東南州博物館的建筑形式頗有民族特色，中央塔樓采用侗族鼓樓重檐形式，東西塔樓采用苗族吊腳樓形式，以外觀來強調黔東南是“苗侗之鄉(xiāng)”，整個博物館由“黔東南概貌館”、“少數(shù)民族風情館”、“少數(shù)民族服飾館”、“龍舟館”和“現(xiàn)代民間工藝美術館”等主題館組成。三樓、四樓是主要的開放展覽區(qū)域。由于黔東南的主要人口構成是苗族和侗族，所以博物館里最重要的是“少數(shù)民族風情館”和“少數(shù)民族服飾館”中的苗族和侗族展廳，這兩個館通過圖、表、實物按歷史、不同分支、習俗等作分類，陳列了很多反應苗、侗兩族日常或難得一見的各種實物，對苗族和侗族的文化、傳統(tǒng)、歷史等都進行了很好的展現(xiàn)。
整個博物館的鎮(zhèn)館之寶在苗族展廳里，里面陳列了一件劍河的錫繡作品，用錫絲作為原料，用傳統(tǒng)的繡法做成一件讓人嘆為觀止的苗裝，顯示了生活在劍河一帶的苗族人高超的刺繡水平。另外一個常規(guī)展出以黔東南不同的市縣為展覽單位，呈現(xiàn)當?shù)靥厣L情，但是布展沒有民族館那么細致精美。
如果你是四五個人結伴同行，則會有博物館館員免費領著你逛博物館，經(jīng)過他們的講解，可以獲得更加清晰的信息。當然了，參觀完博物館之后，館員會帶你去一樓參觀工藝品店，這里面店家的手工藝品品相都不錯，但價格稍貴。館員不會強迫你購買，你隨意即可。在這里還能找到黔東南本土書籍、明信片這類的印刷出版物，可以帶回去作為禮物。